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                InforSense 平台

                InforSense 平台
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                详细说明

                InforSense平台是基于Java 2 Enterprise Edition(J2EE)的一个三层结构的完整应用。中间层是一个构◆建于应用服务器的EAR(Enterprise ARchive),EAR里包含了众多的EJB服务和WAR,EJB服务包括用户空间管理,工作流执行引擎,数据管理,功能节点SDK等等。

                提供了多种客户端与中间层连接,如可以通过RMI协议于服务器端交互的基于java GUI的作为工作流编辑器的客户端,有通过http协议与服务器端交互的InforSense门户,也有通过web service连接的.net的客户端。另外,用户也可以利用Server API定制自己的客户端。 第三层提供了其他的服务,包括数据存储,安※全认证等等。

                产品特性

                InforSense的知识发现平台〇KDE是一个在国际上运用最▃广泛的平台。它可以让企业或研究机构在一个单一的信息框架内整合数据资源、分析软件工具和应用,并将它们及时呈递给跨地域分布组织以及不同领域的科▃学家们■。

                专业领∞域的拓展

                InforSense已经和许多生命科学公司及科研机构成功合作,帮助他们在各种大规▲模的数据分析领域降低成本,节省时间。这些领域包括ㄨ:

                ---序列分析:蛋白质和DNA序列拼接、分析和注释 基于InforSense技术的应用已经在整个生物技术领域为科学家提供了序列比对工具,而且不需要编写硬编码的脚本和CGI。

                ---基因组学:序列信息学和DNA芯片实验分析Ψ 基于InforSense技术的应用可对不同研究领域的质控流程进行标准化。标准化结『果还可对不同公司的研究组和公司的不同项目中产生的︽中间结果进行比较。

                ---代谢组学:分析和检测NMR阵列的生物标记 基于InforSense技术的分析解决方案已经被生命科学研究团体用来理解特定疾病的︼生物代谢标记。InforSense的跨领域分析可以将∩这些标记与基因组的生物标记相关联。

                ---高通量筛选:HTS实验的数〓据获取、质控和靶点选择 InforSense解决方案可将许多HTS过程自动化,并实现快速◥更改和定制。这些过↑程包括获取原始数据、进行质量控制和实◢验操作方法更改后的结果分析。

                ---文库设计:设计用于筛选的分子库 InforSense提供的高级文库设计的应用已经面向所有的ㄨ科研人员,而这原先被认为只有高端用户和专家所采用。这些应用采取了普适≡算法来实现高通量枚举和优化过程。

                ---QSAR/QSPR和分子毒性分析:构建QSAR/QSPR和ADME-Tox模型,进行基于分子的模型〒评分 InforSense应用使〇用户可直接在化学注册系统中建→立模型。模型的评分可以作为查询过程的一部分,这是一个对巨量分子进行评分的快速方法。

                ---转化医学:将临床数据应用于药物发现研究当中 InforSense已经提供了第一个转化医学∏系统产品,它可使临床研究和↙药物发现进程整合在一起,以提高研究项目的设计和执行水平。

                服务快捷发布 –快速共享◆科研应用

                InforSense的分析性Portal技术能够将分析工作流打包成可重用的、可交互的web应用软件。用户可以通过分▲析portal来直接访问工作流,或者将它们内嵌到其它的protal上。 InforSense可以根据终端用户的需求动态地将分析的结果打包,在每次运行应用∑软件的时候动态地将这㊣ 些分析结果发布出来。这意味着这些报表都是标准化的,而且能够在每次需要的时候自动地生成。

                分析portal技▲术允许用户在portal上调整应用软件的参数,这样可以在不㊣ 同的设定下进行分析,然后利用分析结果来支持决策。某一个分析应用软件输出的结果可以自动地作为下一个分析应用软件的输入,这能■够支持分析人员构建高级的分析应用软件。用户可以在指引下逐步地开展分析。 建立一个分析服务并不需要编程,分析人员可以通过InforSense平台提供的工具快速地々部署应用软件。

                轻松管理☉科研及教学成果

                InforSense分∮析工作流技术允许科学研究人员创建分析应用软件,整合科研机构内部的异构数据源,转换并分析这些数据,最终向公众提供可转化☉为行动的智能。

                传统的分析方法通常先由数据库管理员向统计小组的专业分析人员提供数据的样本,然后分析人◥员或者通过开发自定义的代码,或者使用专业的工具来分析这些数据。统计小组分析获得的结果随后提▓交给信息※技术部门,由他们将这些分析结果通过编码整合到商业系统中。在不同的团队之间多次移交意味着需要花费数』月来完成分析策略的制定和更改。

                与之不同的是※,InforSense分析工作流技术消除了这些部门之间的隔阂。分析人员可以使用该技术进行统计分析,也可以用它来开发可嵌入的分析∩应用软件,例如实时推荐引擎、报表和∏仪表盘生成引擎、商业规则集以及数据库更新的存储过程等。一旦开发完成,由分析工作流创建的应用软件可以直接运行在▽InforSense平台上★或者InforSense网格上。

                功能插件

                生物Ψ信息学工具包BioSense

                InforSense BioSense则为分析人员搭建了一个简单易用的友好操作界面,帮助他们进行各种ζ各样的序列分析和操作。用户只需通过拖放式的可视化操作,即可完成多种序列操作任∑务,包括序列提取、查看、注释、比对分析、结构功能预测以及远程搜索等等。构建的序列分析工』作流(Workflow)可快速进▲行部署,并随时发布给任何授权的终端用户使用,从而为您的组织提供一个通用高效的知识发现环境,极大地推进生命科学的研发进程。

                生物信息学工具包GenSense

                GenSense是KDE平台在生↓命科学领域的一个重要功能插件,用于协∴助分析遗传学实验数据。这类数据包括由Affymetrix和Illumina等大规模芯片数据以及用户自己的小规模」数据。GenSense支持常用的数据格式和数据【类型,如HapMap、Pretty-Base和Pedigree等。此外其良好的可扩展性也提供了快捷地整合其它新的数据类型的途径。GenSense能基于基因型和表型的生物学数据构建合理的统计学◥模型,并作多层次的数据分析和筛选。该组件的主要功能是导入和※分析大规模的疾病样本与对照样本的基因型数据,即通过统计学方法从同类样本中鉴别与表型相关的遗传学标记。 然后通过公共数据库以及◇文本挖掘的方法对筛选出▆的遗传学标记进行基因组注释,并进一步得到相关的生物模型。

                化学信息学工具包 ChemSense

                ChemSense不仅具有灵活︼完整的化学信息及药物设计的解决方案,还允许接入和整①合来自主要供应商的各种实验和化学化合物库,数据库,药物设计和化学信息学工具。易用的界面使科学家快速设计、实施∩和执行可扩展的化学信息学及药物设计解决方案,以最大程度满足他们的研发需求。此外,它的可扩展构架允许对网络服务,内部应用和脚本的整合◢。

                文本挖掘工◆具包TextSense

                InforSense TextSense是InforSense KDE软件★中一个特殊的用于文献分析和文本挖掘的延伸◎模块。它同时允许专家和非专家用户迅速地设计、实现、执行和部署定制的文本分析解决方案。 通过简单灵活的方式分析文本数据获取文本中隐含的知ζ识信息, 使专家和普♀通用户都能够设计、实现和执行专业文献分析应用,简便快速地进行部署并通过Portal界面发布卐给终端用户使用。

                转化医学/临床数据研究工具包ClinicalSense

                InforSense ClinicalSense产品为有效分々析和解读医疗数据而设计。通过高度灵活的分析工作流引擎为用户提供一个直观的临床决策支持界面,InforSense可同时对普通和专用(ad hoc)数据进行分析,并整合实█验数据和分析方法。InforSense灵活的病患数据查询和分析工具能够为临床医生提供真知灼见,从而提高治疗决策水平。

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