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产品热度：加载中

品　　牌：SimGlycan

产品型号：聚糖和糖肽MS/MS数据分析工具

适用范围：高教 职教

所在地区：

温馨提示：需求数量不同◥，价格不同。请联系我们，确认当前新的报价！

SimGlycan是一款MSⁿ数据分析软件。它预测聚糖结构，对其进行评分并生成与给定MS谱密切匹配的可能聚糖列表「。支持糖肽和释放的聚糖谱。

SimGlycan根据MS/MS和多级质谱 (MSⁿ) 数据预测聚糖的结构。此外，使用LC-MS/MS糖肽数据分析糖肽的支持有助于糖基化研究。SimGlycan接受实验性MS/MS数据，将它们与自己的数据库▅进行匹配，结果生成排序的候选结构列表。每个候选者的等级表示候选结构和实验聚糖之间的接近度。排名是根据稳健的评分机制计算的，该机制考虑了在实验MS/MS光谱中观察》到的结构特异性诊断离子以及观察到的峰的强度。

SimGlycan还支持异构体分化的多级质谱 (MSⁿ) 数据分析。

SimGlycan特点：

强的聚〒糖和糖肽数据库

SimGlycan数据库是一个大型关系数据№库，包含9,964种聚糖、22,814种糖蛋白*、6,826种已知生物来源的聚糖和5,874种已知类别的聚糖。随着更多聚糖信息的发布，该数据库会不断更新。

支持MALDI MS/MS和LC-MS/MS工作流程

支持H、Li、Na、Mg²⁺、K、HCOO^-和NH4⁺等不同的加合物以及Na+H、Li+H等加合物组合卐，以及基于不同的可扩ξ展 MS/MS碎片模式仪器设置，SimGlycan可以分析糖肽和释放聚糖的MALDI和LC-MS/MS数据，这些聚糖是未衍生ω化、全甲基化和还原端修※饰的，而不会影◇响分析结果。

数据输入文件格式

SimGlycan可以直接自动加载由SCIEX（TripleTOF^TM5600系统、TOF/TOF 5800、4800 Plus MALDI TOF/TOF^TM分析仪、4000 QTRAP^?和QSTAR^?Elite系统）的质谱仪产生的输入数据文件。Agilent Technologies（Agilent 6200系列TOF LC/MS和Agilent 6500系列Q-TOF LC/MS系统），Bruker Corporation（ultrafleXtreme^TM MALDI TOF/TOF, ultraflex^TM MALDI TOF/TOF, autoflex^TMTOF和TOF/TOF, maXis^TM UHR-TOF, micrOTOF^TM, micrOTOF-Q^TM, solariX^TM Qq-FTMS和amaZon^TM离子阱系ω　列），Thermo Scientific^TM（LTQ FT Ultra、LTQ Velos、LTQ XL、LTQ Orbitrap Discovery、LTQ Orbitrap Velos、LTQ Orbitrap XL、MALDI LTQ Orbitrap、Orbitrap Elite, Q Exactive和Thermo Scientific^TMOrbitrap^TMFusion^TMTribrid质谱仪和Thermo Scientific^TMQ Exactive^TM混合四∏极杆-Orbitrap质谱仪）和Waters公司（SYNAPT G2 HDMS、SYNAPT G2 MS、Xevo G2 QTof、Xevo QTof MS、Xevo TQ MS和Xevo TQ-S平台）。使用mzData和mzXML格式支持其『他质谱仪。此外，SimGlycan也接受手动输入、TXT和XLS文件格式。不管你的仪器是什么的，都可以用第三方工具将输出结果转换为Ψ 这些格式。

TMT定量*

SimGlycan现在支持基于质谱的定量糖学◎工作流程，使用aminoxyTandem Mass Tags (TMT)。aminoxyTMT6试剂能够有效的对聚糖进行相对定量，提高标记聚糖的电离效率，从而提高分析通量。通过测量来自相应MS/MS光谱的报告离子峰强度来量化聚糖。用户∏可以指定小至0.0001的容差。提取峰强度后，调整氨氧基TMT报告离子信号以说明每种TMT变体中的同位素杂质。用户可以选择全部聚糖谱匹←配中的总和/平均/中值报告离子强度作为聚糖的数量。各种图表，如条形图、点图等。

多级质谱（MSⁿ）数据分析

SimGlycan包括对执行多级/序列质谱 (MSⁿ) 数据分析的支持。MSⁿ是一种对来自MS/MS（或前级MS）的产物离子进行重碎裂的技术，是解决异质【性、分支模式和同压寡╲糖结构的有效技术之一。它允许区分具有相似特征片段模式的聚糖，这些片段模式在MS/MS光谱中无法区分。随着MS (n)水平的〒增加，生成的片段变得具有结构特异性，这有助于解析同量异位寡糖或对选定结构进行详细表征。

糖肽定性分析

很ξ　多质谱仪允许在化合物从在线分离系统中洗脱时捕获MS/MS 数据。这种LC-MS/MS方法卐会生成很大的数据集，需要复杂的信息学工具在色谱分离过程中分配糖肽结构。这将提高分析◣效率并提供更深入的质∩谱糖蛋白组数据分析。SimGlycan现在支持识别复●杂混合物的糖肽，这些混合物由LC分离并由MS/MS在批处理模式下检测。SimGlycan将使用第三方工具识别的蛋白质ID、蛋白¤质序列或肽序列作为初始输入。SimGlycan识别可能的聚糖-肽组合，并根据MS/MS数据中观察到的峰对它们卐进行排序，这些峰对应于理论糖肽中的诊断离子。可以分析具有1到20 ppm和0.1到2000 milli Dalton (mDa) 之间误差容限的高分辨率准确质量数据。

项目管理

SimGlycan提供项目管理，将结果与输入Ψ 配置文件和搜索参数相关联。您可以打开任意数量的项目。用户可以在一个项目中导入20,000个光谱。项目可以根据来源、实验室或研究目标◥进行分类。这很关键，尤其是在进行大规模聚糖分析项目时。您可以通过单⊙击按钮访问聚糖相关信息。与基于Web的应用程序不同，SimGlycan将其保存在您自己的计算机上。

可用信息包括：

聚糖结构：显示聚※糖的分子结构（碳水化合物序列∞）。

Glycan Fragments：使用Domon Costello碎片规则显示命名法、结构、m/z值和质量。为每个片段分配一个序列号。

i) 糖苷片段：显示单个糖苷和糖苷/糖苷片段。

ii) 交叉环片段【：显示单个交叉环ζ　和糖苷/交叉环片段。

糖肽结构：显示肽序列和蛋白质糖基化位点【以及聚糖结构。

注释质谱并生成报≡告： SimGlycan可以使用cartoons或Domon-Costello命名法对质谱进行注释。还描绘了片段的○电荷状态。

导出带注释的峰列表：用户可以将全部搜索结果的带注释的峰列表从20,000个MS/MS光谱导出到单◤个项目报告。用户可以在带注释的峰列表中只⊙包含匹配的〖片段或同时包含匹配和不匹配的片段。

绘制聚糖

SimGlycan使用户能够绘制和编辑聚糖和糖肽结构。只需单击按钮，即可添加或删除单糖、肽链或HSO 3、Etn等取代基，并可修¤改分支点和异头连接。在每一步，绘制结构的碎片化使用户能够比较实验数据和理论数据，使用户能够查看他的修改是否使理论聚糖更接近实验数据。此功能很大地有助于解析糖链▆结构，尤其是当目标糖链的数据尚不可用时。

质谱解释

软件通☆过突出显示与理论碎片相匹配的实验m/z值来帮助解释质谱，并生成描述连续单糖单元损失的注释光谱。这有助◣于研究人员建立分支模式并验证聚糖的基本单元。每个峰都可以使①用cartoons或Domon Costello命名法来表示。如果碎片是多电荷的，也会显示碎片↑的电荷状态。

SimGlycan能够≡生成带注释的质谱，以适合页面或基于感兴趣的区域。它还会将其导出以♂与您的同事分享发现。

简单的界面使您能够放大特定的绘图位置，指定m/z范围以显示特定的绘图部分，还可以将绘图作为图像文件〇导出到MS PowerPoint，以便发布结果并『与同事共享信息。

Cartoons是使用标准的※单糖功能糖组学（CFG）命名法构建的（在CFG注释不可用的情况下使用自定义符号）。您可以同时绘制全部类型的糖苷片段，同时↑以符号表示格式注释光谱。

*此功能在SimGlycan企业版中可▂用。

SimGlycan企业版

SimGlycan企业版现█已推出。如果您】使用的是私人定制数据库或专有数据，企业版是您正在寻找的解决新型聚糖的安＠全工具。您可以从数据库中添加或删除聚糖结构，或创々建您自己的子数据库以缩小搜索范围，直接从您的工作站方便。多个聚糖的结构信息可以存储在一个文件中并添加到数据库中，从而节省时间。

系统要求：

Windows 支←持的平台：Vista/Windows 7/Windows 8/Windows 10/Windows 11